Guide complet sur les enterocoques dans l'eau : indicateur de contamination fecale ancienne, complementaire d'E. coli, seuils reglementaires et methodes d'analyse normalisees.
Les enterocoques intestinaux (anciennement streptocoques fecaux) sont un groupe de bacteries a Gram positif du genre Enterococcus (principalement E. faecalis et E. faecium). Ils sont plus resistants que E. coli dans l'environnement et face aux traitements de desinfection, ce qui en fait un indicateur complementaire precieux pour detecter les contaminations fecales anciennes ou persistantes. Leur presence dans l'eau potable est interdite : 0 UFC/100mL.
Les enterocoques sont des bacteries spheriques (coques) a Gram positif, groupees en chainettes ou en diplocoques. Le genre Enterococcus comprend plus de 50 especes, dont les deux principales en microbiologie de l'eau sont Enterococcus faecalis (60 a 80% des isolats) et Enterococcus faecium (20 a 30% des isolats).
Comme E. coli, les enterocoques sont des habitants naturels du tube digestif de l'homme et des animaux a sang chaud. Leur presence dans l'eau indique donc une contamination fecale. Cependant, leur comportement dans l'environnement differe significativement de celui d'E. coli, ce qui leur confere une valeur d'indicateur complementaire et distincte.
La caracteristique majeure des enterocoques est leur extreme resistance. Ils survivent dans des conditions hostiles ou E. coli serait rapidement elimine : temperatures elevees (jusqu'a 60 degres C pendant 30 minutes), pH extreme (pH 3 a pH 12), forte salinite (6,5% de NaCl), secheresse prolongee et presence de desinfectants (chlore, UV). Cette resistance leur permet de persister des semaines a des mois dans l'eau, les sols et les sediments.
| Critere | E. coli | Enterocoques |
|---|---|---|
| Type de contamination | Recente | Ancienne/persistante |
| Survie dans l'eau | Jours a semaines | Semaines a mois |
| Resistance au chlore | Moderee | Elevee |
| Resistance aux UV | Moderee | Elevee |
| Origine | Exclusivement fecale | Principalement fecale |
| Delai d'analyse | 24 heures | 48-72 heures |
| Parametre | Milieu | Limite | Reference |
|---|---|---|---|
| Enterocoques | Eau potable | 0 UFC/100mL | Code de la sante publique |
| Enterocoques | Eaux de baignade (eau douce) | 330 UFC/100mL | Directive 2006/7/CE |
| Enterocoques | Eaux de baignade (eau de mer) | 185 UFC/100mL | Directive 2006/7/CE |
En tant qu'indicateurs, les enterocoques ne sont generalement pas eux-memes la cause directe de maladies hydriques. Toutefois, leur presence signale un risque de contamination par des pathogenes d'origine fecale. De plus, certaines especes d'enterocoques sont devenues des pathogenes opportunistes importants en milieu hospitalier :
Leur presence dans l'eau potable signifie que des pathogenes enteriques (virus, bacteries, parasites d'origine fecale) peuvent egalement etre presents. Les epidemies historiques de gastro-enterites liees a l'eau contaminee montrent une correlation forte entre la presence d'enterocoques et le risque infectieux. L'OMS considere les enterocoques comme un indicateur de risque sanitaire complementaire indispensable.
En milieu hospitalier, E. faecalis et E. faecium sont responsables d'infections nosocomiales (infections urinaires, endocardites, bacteriemies). L'emergence d'enterocoque resistant a la vancomycine (ERV) est un probleme majeur de sante publique. Cette resistance aux antibiotiques renforce l'importance de surveiller ces bacteries dans les reseaux d'eau des etablissements de sante.
La methode de reference pour la recherche des enterocoques intestinaux dans l'eau est la filtration sur membrane selon la norme NF EN ISO 7899-2.
100 mL d'eau (ou un volume adapte) sont filtres sur une membrane de 0,45 micron qui retient les bacteries. Le prelevement doit etre realise dans un flacon sterile et transporte au laboratoire dans les 24 heures a une temperature inferieure a 6 degres C.
La membrane est deposee sur un milieu selectif Slanetz-Bartley et incubee a 36 degres C (+/- 2 degres C) pendant 44 heures (+/- 4 heures). Les enterocoques produisent des colonies typiques de couleur rouge, marron ou rose par reduction du chlorure de triphenyltetrazolium (TTC).
Les colonies presomptives sont transferees sur un milieu bile-esculine-azide (BEA) et incubees a 44 degres C pendant 2 heures. La confirmation est positive si les colonies produisent un halo noir (hydrolyse de l'esculine en presence de fer).
Les colonies confirmees sont denombrees et les resultats exprimes en UFC/100mL (unites formant colonies pour 100 millilitres). Le seuil de detection est de 1 UFC/100mL. Le delai total d'analyse est de 48 a 72 heures.
La detection d'enterocoques dans l'eau potable constitue une non-conformite majeure. Les actions a mener sont similaires a celles pour E. coli, mais la recherche de la source peut etre plus complexe en raison de la persistance de ces bacteries dans l'environnement.
Analyse microbiologique complete incluant E. coli et enterocoques. Laboratoire accredite COFRAC.